4月9日，北京小客車指標調控管理辦公室公布了2016年第二期小客車指標申請審核結果和配置情況。累計收到個人示范應用新能源小客車配置指標申請和確認延期的共11327個。
截止到2016年4月8日24:00，小客車配置指標累計收到個人普通小客車配置指標申請和確認延期的共2690457個；有43361家企事業等單位申請普通小客車配置指標70796個；累計收到個人示范應用新能源小客車配置指標申請和確認延期的共11327個；有1217家單位申請示范應用新能源小客車配置指標1616個。按照規定，有關部門將對申請信息進行審核，審核結果將于4月25日在北京緩解擁堵網站公布。
2016年第一期小客車指標配置個人示范應用新能源小客車指標12214個，申請數約占個人全年指標的四分之一。配置單位示范應用新能源小客車指標為1819個。
根據市小客車指標辦此前發布的通知，2016年小客車指標年度配額為15萬個，其中示范應用新能源指標額度6萬個(個人5.1萬個，單位3000個，營運6000個)。根據新的配置辦法，今年的新能源指標向申請人直接配置，按照申請時間先后排序，如果新能源小客車指標申請人數超過6萬，超過部分按照申請時間順序輪候，在下一年度優先配置，也就是2017年優先配置。也就是說，新能源車將不再按照搖號時的整數平均分配原則，而是6萬個指標發完為止，“先到先得”。按照目前的速度，本年度新能源指標在今年第四期即8月份就會全部配置完畢，想要申請新能源指標的市民只能等待明年。
北京市汽車搖號每兩月舉行一次，自2014年2月26日第一期新能源汽車搖號以來，共舉行了十二期搖號，其中，第十一和十二期的新能源汽車申請數直接配置，2014-2015年北京共配置新能源汽車指標66587個，其中個人50861個，單位15726個。